In overeenstemming met het Samenwerkingsakkoord Klimaat kan de NKC zich laten ondersteunen door werkgroepen voor materies die een verder onderzoek of beoordeling vereisen.
Momenteel zijn de volgende werkgroepen actief ter ondersteuning van de NKC bij het uitvoeren van haar opdrachten:
- Adaptatie
- Beleid en maatregelen
- CBAM (Carbon Border Adjustment Mechanism)
- CCUS (Carbon Capture Use and Storage)
- DNA/FP
- Emissies (CCIM)
- ETS Luchtvaart
- ETS Scheepvaart
- ETS Vaste installaties
- ETS 2
- F-gassen
- Flexibiliteitsmechanismen
- Governance
- Innovatiefonds
- Langetermijnstrategie (gezamenlijke WG NKC-CONCERE)
- LULUCF
- Methaanverordening (gezamenlijke WG NKC-CONCERE)
- Nationaal Energie-Klimaatplan (gezamenlijke WG NKC-CONCERE)
- Nationaal Register
- Nationale Mededeling/Tweejaarlijks Rapport/Tweejaarlijks transparantierapport
- Prognoses
- Reporting Climate Finance
- Sociaal Klimaatfonds
- SWA Burden Sharing